Ninja Senshi Tobikage, Joe Maya adında bir çocuğun hikayesini anlatır. Mars'ta yaşayan Joe, bir gün uzaylılar arasındaki bir savaşa tanık olur. Zaboom Gezegeni'nden gelenler, evreni fethetmeyi planlayan Zaboom İmparatoru'ndan kaçan ve Mars'a iniş yapan Radorio Prensesi'ne saldırıyordur. Joe, prensesin gemisine tökezleyerek biner ve bu, hayatlarını değiştirecek bir olaylar zincirini başlatır. Joe

Ninja Senshi Tobikage, Joe Maya adında bir çocuğun hikayesini anlatır. Mars'ta yaşayan Joe, bir gün uzaylılar arasındaki bir savaşa tanık olur. Zaboom Gezegeni'nden gelenler, evreni fethetmeyi planlayan Zaboom İmparatoru'ndan kaçan ve Mars'a iniş yapan Radorio Prensesi'ne saldırıyordur. Joe, prensesin gemisine tökezleyerek biner ve bu, hayatlarını değiştirecek bir olaylar zincirini başlatır. Joe ve arkadaşları, Zaboom İmparatoru ve kuvvetlerine karşı üç güçlü mecha beast kullanırlar, ancak tüm zorluklar onlara karşıdır. Tüm umutlar tükenmiş gibi göründüğünde, gizemli bir ninja robot olan Tobikage, yardım sağlamak için sanki yoktan var olur. Üç mekanik canavarla birleşebilen Tobikage, eşsiz bir güç kazanır ve onun yardımıyla Joe, Zaboom kuvvetlerine karşı savaşır...